El primer partido que protagonizaron el Club Nacional de Football de la República Oriental del Uruguay, y el Club Atlético Boca Juniors de la República Argentina del cual hay registros fehacientes, es un amistoso que se llevó a cabo en el Gran Parque Central el 18 de marzo de 1917. Fue victoria Tricolor 5-2 con tres tantos de Carlos Scarone y dos de Alfredo Ángel Romano. Lázaro Amores, mediante un doblete, descontó para los Xeneizes.

Dos años más tarde se enfrentaron en otro pleito no oficial que tuvo lugar en territorio boquense el 11 de noviembre de 1919. Ganó 2-0 el dueño de casa con dos goles de Alfredo N. Martín.

Ya en 1920, Nacional y Boca Juniors tuvieron sus primeros duelos oficiales entre sí. El 16 de mayo jugaron en el Gran Parque Central por la Copa Ricardo Aldao 1919. Los uruguayos se impusieron 3-0 gracias a los tantos de Héctor Pedro Scarone, Alfredo Ángel Romano y Pascual Somma. Y el día 25 del mismo mes se vieron las caras en la cancha de Sportivo Barracas. Por la Copa Competencia (Final Internacional) del año anterior, Boca venció 2-0 merced a dos cabezazos de Pedro Miranda y Pablo Bozzo respectivamente.

Empataron por primera vez de manera oficial el 28 de diciembre de 1940. Fue 2-2 en el Estadio Centenario por la Copa Ricardo Aldao de esa temporada. Atilio Ceferino García en dos ocasiones anotó para los charrúas, mientras que Raúl Florio Emeal y Bernardo José Gandulla lo hicieron para los porteños. 

El 19 de marzo de 1947, el Bolso y el Xeneize se enfrentaron de manera amistosa en La Bombonera. Igualaron 4-4. Mario Emilio Heriberto Boyé, Pío Sixto Corcuera, E. Valentini y Eduardo Ricagni convirtieron los tantos para los argentinos. Walter Gómez en dos oportunidades, Enrique Castro y José Medina hicieron los propio para los uruguayos. Este fue, además, el partido con mayor cantidad de goles que ambos protagonizaron.

La victoria más amplia de Nacional sobre Boca Juniors se produjo el 22 de enero de 1955. Fue 5-0 en el Estadio Centenario con goles de Guillermo Escalada, Juan Ángel Romero en dos ocasiones y Samuel Orellano en dos oportunidades. Por el lado de Boca, el triunfo más holgado sobre Nacional tuvo lugar el 15 de agosto de 1968. Fue 5-1 en terreno propio gracias a los tantos de Alfredo Hugo Rojas x 2, Antonio Ubaldo Rattín, Antonio Roberto Cabrera y Milton Viera. Domingo Salvador Pérez descontó para la escuadra uruguaya. Vale agregar que ambos encuentros fueron amistosos. 

Durante la década del '70 el Estadio Centenario fue escenario de tres juegos no ofiales. El 5 de febrero de 1973 ganó Nacional 4-3 (Ildo Enrique Maneiro, Juan Carlos Masnik, Juan Carlos Mamelli, Víctor Rodolfo Espárrago / Carlos Alfredo Guerini, Osvaldo Rubén, Oscar Rubén Peracca). El 10 de diciembre de 1975, Boca venció 1-0 (Osvaldo Rubén Potente). Y el 23 de febrero de 1978, el elenco uruguayo se impuso 2-1 (Alfredo de los Santos, Juan Ramón Carrasco / Miguel Ángel Bordón).

Por los Octavos de Final de la Supercopa 1991, empataron 1-1 en La Bombonera el 3 de octubre con goles de Walter Reinaldo Pico para el anfitrión, y de Julio César Dely Valdés para la visita. Seis días después, Venancio Ariel Ramos y Héctor Eduardo Morán le daban el triunfo 2-0 al Bolso en el Estadio Centenario.

Dentro del marco de la Copa Mercosur, protagonizaron dos juegos en la Primera Fase correspondiente a la edición del año 2000. El 29 de agosto finalizaron 1-1 en La Bombonera con anotaciones de Martín Palermo para el anfitrión, y de Jorge Hernán Bermúdez en contra para la visita. El 18 de octubre, igualaron 3-3 en el Estadio Centenario. Pablo Eduardo Islas x 2 (el primero de penal) y Mario Ignacio Regueiro convirtieron a favor de los uruguayos, mientras que Hernán Esteban Medina y Antonio Daniel Barijho x 2 hicieron lo propio para los argentinos. 

Ambos vencieron por el mismo resultado y en condición de local dentro de los Octavos de Final de la Copa Sudamericana 2006: 2-1. Nacional ganó el 28 de septiembre (Marcos Marcelo Tejera, Diego Martín Alonso / Rodrigo Sebastián Palacio) en Montevideo. Y Boca, el 12 de octubre (Rodrigo Sebastián Palacio, Nicolás Santiago Bertolo / Diego Rafael Perrone) en Salta. Dada la paridad, hubo que recurrir a la definición por tiros desde el punto del penal. Allí, la escuadra uruguaya ganó 3-1 y accedió a la siguiente instancia del torneo. A continuación, el detalle de las ejecuciones, donde el primero en patear fue el cuadro argentino: Guillermo Barros Schelotto (gol) 1-0; Javier Omar Delgado (gol) 1-1; Juan Ángel Krupoviesa (atajado por Washington Alexis Viera) 1-1; Jorge Andrés Martínez (desviado) 1-1; Claudio Marcelo Morel Rodríguez (desviado) 1-1; Jorge Orlando Brítez (gol) 1-2; Fernando Rubén Gago (atajado por Washington Alexis Viera) 1-2; Hugo Diego Arizmendi (gol) 1-3.

En 2016 se cruzaron en los Cuartos de Final de la Copa Libertadores de América. El 12 de mayo empataron 1-1 en el Gran Parque Central. Frank Yusty Fabra puso en ventaja a Boca cuando se cumplían 25’ del segundo tiempo. Sebastián Bruno Fernández emparejó las acciones a los 31’. Siete días más tarde jugaron la revancha en La Bombonera e igualaron por idéntico resultado. Abrió la cuenta Daniel Alberto Díaz en contra para Nacional a los 20’ de la etapa inicial. Cristian David Pavón le dio el empate a Boca a los 27’ del segundo tiempo. Posteriormente, la escuadra argentina, en la definición por tiros desde el punto del penal, se impuso 4-3. A continuación, el detalle de la serie en la que arrancó pateando el elenco uruguayo: Diego Fabián Polenta (gol) 1-0; Carlos Alberto Tevez (gol) 1-1; Mauricio Bernardo Victorino (gol) 2-1; Daniel Alberto Díaz (gol) 2-2; Sebastián Bruno Fernández (gol) 3-2; Pablo Javier Pérez (atajado por Esteban Néstor Conde) 3-2; Gonzalo Fabián Porras (atajado por Agustín Ignacio Orión) 3-2; Juan Manuel Insaurralde (atajado por Esteban Néstor Conde) 3-2; Santiago Ernesto Romero (atajado por Agustín Ignacio Orión) 3-2; Frank Yusti Fabra (gol) 3-3; Felipe Ignacio Carballo (atajado por Agustín Ignacio Orión) 3-3; Federico Gastón Carrizo (gol) 3-4.    

 

Jugaron por última vez el 2 de agosto de este año por los Octavos de Final (ida) de la presente edición de Copa Libertadores de América. Igualaron 0-0 en Montevideo.    

                                                   

Entre partidos oficiales (17) y amistosos (48), hay un total de 65 juegos comprobados entre ambos. Los uruguayos se impusieron en 21 ocasiones y convirtieron 105 goles. Los argentinos triunfaron en 22 oportunidades y señalaron 103 tantos. Empataron 22 veces. 

Algunos de los futbolistas que vistieron ambas camisetas son: Nicolás Santiago Bertolo, Rubén Fernando Da Silva, Emmanuel Gigliotti, Pablo Eduardo Islas, Marcelo Nicolás Lodeiro, Sergio Daniel Martínez, Marcos Gustavo Mondaini, Marcos Marcelo Tejera y Aníbal Tenorio, entre otros. Adolfo Alfredo Pedernera y Rodolfo Martín Arruabarrena dirigieron a los dos equipos.